Namun, mesin telah mengalami pemetaan ulang sehingga menghasilkan tenaga maksimal 124 PS, sedikit lebih rendah 1 PS dibandingkan model sebelumnya.
Penyesuaian ini dilakukan demi memenuhi regulasi emisi terbaru, namun di sisi lain meningkatkan efisiensi bahan bakar.
Konsumsi bahan bakar kini mencapai 20,5 km/liter, meningkat dari sebelumnya yang hanya 18 km/liter.
Selain itu, Kawasaki juga membekali model 2025 dengan throttle elektronik baru yang memungkinkan pemasangan fitur Quick Shifter dan Cruise Control sebagai perlengkapan standar.
Motor ini juga dilengkapi dengan Bosch IMU yang meningkatkan sistem ABS serta menawarkan empat mode berkendara: Sport, Road, Rain, dan Manual.
Sistem ini juga berperan dalam mengatur tingkat traksi kontrol dan power mode sesuai dengan kondisi jalan serta preferensi pengendara.
Dari segi suspensi, Kawasaki Z900SE 2025 tetap mempertahankan perbedaan signifikan dengan varian standar.
Model SE menggunakan suspensi belakang Öhlins S46 yang dapat disesuaikan dengan pengatur preload jarak jauh tanpa memerlukan alat khusus.
Pada sistem pengereman, motor ini tetap menggunakan kaliper Brembo M4.32, yang merupakan model terbaru dari lini Brembo dan menawarkan performa pengereman lebih presisi.
Motor ini juga hadir dengan layar instrumen TFT berukuran 5 inci yang kini memiliki peningkatan fungsi. Dengan aplikasi RIDEOLOGY, pengendara bisa mendapatkan navigasi turn-by-turn dan kontrol suara langsung dari layar.